Московский институт новых информационных технологий осуществляет свою деятельность на основании государственной аккредитации и лицензии, выданной Министерством образования и науки Российской Федерации.

Институт осуществляет свою учебно-научную деятельность в интересах ФСБ России и иных федеральных органов исполнительной власти. В целях организации качественного учебного процесса, Институт активно привлекает к преподавательской деятельности кроме штатных преподавателей Института, ведущих специалистов органов безопасности Центрального аппарата, а также специалистов, проходящих службу в Московском регионе. Кроме того, Институт активно использует знания и опыт ведущих вузов города Москвы.

Образовательный процесс в Институте организован по двум направлениям:

• первое направление – повышение квалификации. Курсы повышения квалификации есть краткосрочные от 72 до 100 часов, после прохождения которых  слушателям выдаётся удостоверение о повышении квалификации и среднесрочные курсы от 100  до 500 часов, по результатам которых слушателям выдаётся свидетельство о повышении квалификации.
• второе направление деятельности – это профессиональная переподготовка. Курсы ведутся от 500 до 1000 часов. По итогам обучения выдаётся диплом государственного образца с правом ведения профессиональной деятельности в новой сфере.